Do S2 IS jest kilka wersji firmware: E, F, G, I. Też pierwszy raz się spotykam z takim czymś. Jeszcze nikt nigdy nie zgłaszał uszkodzenia aparatu. Nie mam zupełnie pojęcia jakie konsekwencje może mieć wgranie niewłaściwej wersji, bo chyba nikt się jeszcze nie pomylił. To co piszesz jest bardzo dziwne, bo CHDK wczytuje się z karty pamięci. Nie ma fizycznej możliwości zapisania lub zmieniania czegokolwiek w pamięci wewnętrznej. Jednak z tego co piszesz coś musiało pójść nie tak. Niestety, nie jestem w stanie wpaść na żaden pomysł. Jak coś wymyślę to napisze.
Napisałem o Twoim przypadku na anglojęzycznym forum CHDK. Tutaj masz link: http://chdk.setepontos.com/index.php/topic,2331.0.html